主题：【讨论】今天听了一个会，混了两顿饭，虽然不好吃。 -- 喜欢喝冰茶

是有确定的序列信号的。ENCODE之前给出TSS中噪声比较大，因此看上去像是随机的，但是后来有文章已经修订了。说来说去，还是CpG罢了。

现在的问题是，如果那些低表达RNA没有功能，那么为什么其中许多都是tissue/cell specific expressed的？另外，RNA的功能，过去认为主要直接参与基因表达，mRNA,rRNA,tRNA,miRNA,siRNA等等。不过现在也有guide RNA的提法，正符合了1960年代caltech的EH Davidson提出的模型。呵呵，很是巧合。同时，dsRNA还可也作为decoy来影响转录因子与DNA的结合（NRSF，Cell）。更妙的是，RNA或许会参与维持chromatin的动态结构（这个说法谁提的？我不记得了）。除此之外，很多RNP（RNA binding proteins）的功能也没有搞清楚，留下很多探索空间。

所以，我的看法跟你有些不同，我觉得目前人类对细胞的表达控制系统的理解还差的很远。究其原因就在于“数据不够”。通过一斑是无法窥全豹的，而目前我们连一斑都说不准有没有。所以还是要放开胸怀，先接受所有能想到的可能性，再逐一验明其本质。