主题：【讨论】纯好奇，西部爪蟾这东西什么地方用的多？ -- 喜欢喝冰茶

今天看杂志，看到一篇有关西部爪蟾基因组的文章。记得非洲爪蟾（Xenopus laevis）很多地方用，但是不太了解这个西部爪蟾（Xenopus tropicalis），非洲爪蟾的基因组没测出来？

tropicalis是爪蟾里唯一的二倍体，其它的种都是伪四倍体（science文章里提了一下：paleotetraploid，古四倍体（解释：古多倍体）），所以比较容易利用遗传学方法研究。

非洲爪蟾是伪四倍体，很多重要的遗传学方法是基本上没有办法用在它身上的，比如说做基因敲除。

测序的话，非洲爪蟾的单倍体基因组几乎要比西部爪蟾长一倍（32亿：17亿碱基对）。照我理解这是因为非洲爪蟾是伪四倍体，也就是说，非洲爪蟾的单倍体基因组实际是个单倍体翻倍了之后略有削减造成的缩水版二倍体。

西部爪蟾基因组测序页面，现在放出来的是assembly 4.1

开头大致介绍了一下西部爪蟾的用途和过去的贡献。没有提到要测非洲爪蟾。难道是说两个里面挑一个，另一个不测了？两种爪蟾的亲缘关系非常近，所以测了一个说不定也够了。

不过也许是测了这个再测下一个。因为二者都太重要了。

NCBI 爪蟾基因组页面：

外链出处目前ncbi里只有两个物种的线粒体基因组。

wikipedia Xenopus:

wikipedia Western clawed frog

爪蟾是研究脊椎动物发育的重要模式生物。西部爪蟾比非洲爪蟾体型小，产卵量大，代间时间短，所以用来研究发育比用非洲爪蟾方便。非洲爪蟾代间时间是1－2年，躯干长约10cm。这两种爪蟾都相当皮实，比较好养。

爪蟾卵是发育生物学常用的材料，童第周同学切蛙卵那个故事估计说的就是切非洲爪蟾卵。非洲的卵比较大一些，直径1.2mm，比较好切；西部爪蟾卵直径0.8mm左右，也还切得。

两种爪蟾在细胞生物学里用得也多，比如它们的血红细胞。不过不知道用的主要是哪种的。

说起来也巧，我两周前在电梯里刚第一次看到有人运爪蟾（看大小大概是非洲版），样子还挺好玩的，实际上比下面这个图片里的好看些。

雌性非洲（左）和西部（右）爪蟾：

中科院的发育所一直可以买到，但是没注意过这种西部爪蟾在遗传上的应用。这东西在遗传上作为一个model主要研究什么东西？是遗传行为还是和人类致病基因相关？

非洲爪蟾这东西和普通的蛤蟆真的相差太多，全身极滑，小爪在手心上挠挠挺好玩儿的。不过我们用猪肝喂它，幸好吃的不多。

3.4应该不是个太大的挑战，既然1.7都给搞出来了。上次从23买的进展如何了？

以前要过一个他们那个玩意儿，挺好玩儿的。