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主题:【文摘】复旦26岁研究生破“基因天书”密码 震惊世界 -- Melon
事先声明,我还没有看过原文,只是根据这篇报道作一点小的评论。
从文章里看,作者发现了一种新的转座子,可以随机(注意是随机)的将目的片断插入小鼠基因组中,从而大规模在基因组中制造突变。这种方法,用他们的话来说可以“更为高效、快速地破解“基因天书””云云。
这里有两个问题。第一,这确实是一种很新的方法,但在这之前已经有了好几种很成熟的,高效产生突变的方法,比如ENU诱变,重组病毒,甚至转基因,第一种产生点突变,后两种和复旦组的方法一样,都是在基因组中随机插入设计的大片段。这些虽然与复旦发现的方法机理不同,但结果是类似的。实际上,在以小鼠作模型的研究中,这几种方法用的越来越少了,其原因就是研究的瓶颈不在确定感兴趣的基因,而是确定基因作用的原理,也就是我想说的下一个问题。
第二个问题,蛋白质的功能性研究。
发现感兴趣的突变后的第一件事情,是确定受影响的是什么样的基因,首先,要对基因定位(mapping)。小鼠的基因组大约有2.5Gb(10 to the 9th)个碱基对,而突变影响的只是其中很小的一部分,所以,这个就像是海底捞针的。于是就要做很多的mating,根据已知的genetic marker,做linkage analysis,缩小到一个小片段,这可是很大的工作量,mating做的越多,确定的片段越小。确定后,根据小鼠基因组的序列确定这个片段中编码的基因,一般有几十上百吧,根据基因的expression pattern, predicted strucure等等各种各样的信息,推测那些是最有可能的candidate gene,然后再进行序列分析(可以做什么 PCR, sequencing, sscp, denaturing hplc...,吐血ing,太多了,,大家也看不下去了,我也写不下去了)最终确定受影响的那个基因。
太长了,先发这一部分,待会在接着写
to be continued
- 相关回复 上下关系8
还是有问题的。。 重组 字42 2005-07-31 18:02:39
我觉得这个发现最大的意义在于 大鹏翔宇 字300 2005-07-28 12:33:47
【文摘】解读基因的“里程碑式”新方法在复旦诞生 2 远走迦南 字3176 2005-07-26 21:55:05
泼一小点冷水
补充一点 4 森林的火焰 字2583 2005-07-26 21:27:00
😄这个说得好!我来搅混水! 花老乔 字921 2005-07-26 20:15:48
😁原来如此.怪不得 蜻蜓点水 字74 2005-07-26 20:26:13
将要发的原文在这里 铁手 字70 2005-07-26 19:55:15