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主题:【讨论】今天听了一个会,混了两顿饭,虽然不好吃。 -- 喜欢喝冰茶

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家园 我自己有个相关的项目正在申请

所以做过一点功课。我是做bioinformatics的,所以对技术本身谈不上特别了解,随便聊聊吧。

Affymetrix不去说他了,现在苦苦支撑chip那一块,好像找rich young全世界跑一圈代言过,那也没有用,科技才是第一生产力啊。

454是老技术,一个run几百万个bp,三年前这个已经了不起了,叫做high-thoughput,但现在没用了,望illumina和abi之尘而不及。

现在的主流是illumina的illumina/solexa和abi的solid(你提到ali,怀疑是笔误)。去年illumina的solexa刚出来的时候处理能力是几千万bp/run,号称1G,现在改进后真正能够达到1G以上了 (也就是说,理想情况下3个run就可以做whole-genome sequencing, 但事实显然不是这样)。为了跟454区别,叫做ultra-throughput. abi 的机器能力也达到1G, 而且据说sequencing alignment的算法比illumina强,但illumina起家早,市场占有率高,这是abi不能比的。为了挖illumina的墙脚,abi到处邀请人去他们公司参观,上半年我的一个同事也去了,据说一副欣欣向荣的样子。

情况大致如此,所以要买股票的话,建议买illumina和abi的。

再回到市场应用的话题。illumina和abi的机器是基础,但要预测疾病需要数据库和算法,这就是你提到的那些IT公司干的事。目前这些公司其实还是基于chip,原因很简单,现在基于sequencing的分析技术才起步不久(这也是我申请的项目的目标)。但一两年内sequencing替代chip的趋势是不可逆转了。

另外,现在这些公司的产品玩的还只是概念,远远还谈不上成熟。首先,也是最重要的一点,现在对跟疾病相关的SNP的研究还不够深入,数据不够多,要建立相对准确的疾病预测的概率模型相当困难; 其次,chip是不可能做到真正的genome-wide的,这是由primer design的盲点所决定的;只有sequencing才能做到genome-wide.而要覆盖整个genome的99%,大约需要处理7倍genome-size的bp, 就目前的sequencing技术而言,至少还要几万美元。所以,在这些方面还有非常大的研究空间,当然只有这样我们这些人才有饭吃。

对23andme的惊人报价,我估计23andme的超低价连成本都不够。这个我认为不是市场策略,而是为了搜集数据。我已经说了,预测的能力取决于数据,而要搜集成千上万的数据,经费可能远高于买机器。23andme很聪明,降低报价的结果就是别人给了你数据的同时还给你付一笔钱,这是很有眼光的一招。当然也得靠google的后台才玩得起。

如果对sequencing技术感兴趣,不妨看一下这个论坛:http://seqanswers.com/

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