主题：【原创】生命其实很简单（一）前言 -- 水风

在核酸与蛋白质的关系中，蛋白质无疑是始终处于下一级的地位。核酸可以凭借着全套的核酸机器，生产出蛋白质，并利用生产出的蛋白质，来加速自己的复制，修复，以及生产更多的蛋白质。不客气地讲，蛋白质的地位和奴隶很相像，要做绝大多数的活，但是生死大权却是掌握在那些无所事事的核酸老爷手中，尽管来自相残杀的还是蛋白质。核酸是如何控制蛋白质，并使之成为自己的工具的过程，是现代生物学和化学最不清楚地一部分。妖道只能凭借现存的一点点蛛丝马迹来推断最早的情形。所以这一部分，也是最不可信的一部分。

核酸在进化的早期，依据自身可以形成配对双螺旋的特性，很快就占据了自我复制排行榜的首位。第一次出现可以完全自我复制的大分子，的确让大家大吃了一惊。但是时间一长，这种可以自我复制的把戏就被人看透了，因为只有非常简单的结构，才能够凭借自己的力量迅速完成这个过程。结果那些长度增加，复杂度增高的核酸，发现自己很快被淹没在那些无意义的短序列中，自我复制始终只能象小孩过家家一样，玩玩而已。整个生命的前期过程遭遇到了第一个瓶颈问题：如何保证自我复制的条件下，增加个体的复杂度。这牵扯到一个向更高一级演化的过程，过不了这一关，生命就无从谈起。

这个时候，两条平行的进化路线出现了。一条是在核酸中寻找伙伴，随着原始汤被区域化，然后又重新融合，连续几次的过程。几个核酸暴发户得以凑在一起，形成暂时性的联合。这些联合当中，绝大多数的联合是无意义的，并不能对个体的存在提供什么好处。但是，随着时间的推移和各种联合体存在的可能性的进一步提高，就像乐透彩终归要有人中将一样。具有更高效率，更准确的复制的联合开始出现了，这些联合无疑会因为这些合作相应，进一步巩固这些联合的存在，并大大的扩张了这些联合存在的区域。

而在同时，在某些区域占有主导地位的核酸终于迎来了一个新的伙伴家族，短肽。短肽复杂多变的侧链集团，赋予了短肽高度的活性，可以大大提高某些特定反应的速度。一个具有催化作用的短肽可以在短时间内将与之配合的核酸含量提高几十倍甚至上百倍。

我们前面提到的某些具有更高的复杂度的核酸分子，因为这些新成员的介入，得以提高自己的浓度，从而参与到了进化的行列中来。

短肽的介入只是一个偶然事件，因为此时还没有让短肽精确复制的机制存在。核酸与短肽的联合将随着短肽的消亡而烟消云散。但是，这些受益于短肽的核酸序列却从此留了下来，在大规模的核酸混合体中占有了一席之地。

与此同时，一些看起来毫不相关的核酸产生出了催化短肽生成的能力，这些核酸将成为奴役蛋白质计划的第一批人手。然而此时，他们还是默默无闻的存在于流行的短序列中。

另外一些偶然的进化是某些核酸序列具有了将氨基酸（短肽的基本结构单位）连接在另外一个核酸上的能力。而这些核酸，无疑是在当时占有主导地位的短序列。

当第一个可以几乎自我复制的核酸联合体出现的时候，所有这些在现代蛋白质合成中占有主导地位的核酸序列还都是默默无闻，有些根本还没有来得及出现。但是，在以后的十几亿年间，这些必要的零部件回一个个的出现，并被完全偶然的事件逐渐汇聚到了一起，产生出第一台短肽生产机器。

但是，这台短肽生产机器生产出来的产品，也许是极端无聊的重复，也许是没有任何功能的杂乱序列。但是，随着时间的推移，某些蛋白生产机器可以产生出一些有催化作用的短肽，而这些短肽反过来又推动着可以生产他们的机器在核酸王国中占有更加重要的地位。

时间，可以唯一可以忽略概率的单位，几亿年的时间足以使任何小概率事件发生一两次，甚至几十次，几百次。这些具有高度复制性的核酸组合一旦被产生出来，其存在的可能性就不再是小概率事件了。而是具有比其它的组合更大的生存可能。以后的每一次正方向的推动，也都是以同样的方式被固定了下来。

最终，一个成熟的蛋白质生产机器，一组高度配合的核酸被生产了出来。从第一个可翻译序列的出现，到越来越多的核酸被蛋白质取代原有的工作，还是一个漫长的时间。但是，相比第一台机器的出现，以后的改进工作要快得多。

就这样，蛋白质成为了核酸王国的第一个奴隶。

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佩服啊佩服。。。。。。

坚持就是胜利！

很想了解这些方面的知识，仔细阅读之后，想些问题和您讨论。

写这样的书，不容易。不过我觉得能坚持下来就是胜利。看看有关的讨论我也能学到很多东西。

蜜饯在此鼎力支持就是了。

大家只看黑字就可以了，如果你读不懂的话，再看蓝字的解释。

最早的类生命体，（就像类人猿的命名，指已经具备了生命体的一些特征，但是还不是完整的生命体。并不具备生命体的三个特征：复制，新陈代谢和遗传变异。）据认为，应该是分为两大类，一类是核酸类，即RNA或者DNA链结构，另一类是蛋白质类，即类似目前存在的蛋白质，但是里面的氨基酸的成分也许是部分或者完全不同的。

这两类物质是在浓浓的原始汤（就是地球形成的初期，因为火山爆发，雷鸣闪电而形成了大量的有机物，这些有机物溶解在原始海洋里面，日积月累，形成了浓浓的原始汤）里面自发形成的。此时，所有的分子都是出于一种合成的化学平衡中，（即所有的分子都在不停的分解与合成中，最终的浓度取决于分解速度与合成速度的差异，原料的含量直接决定了合成的速度。如果原料是极大丰富的，那么合成的速度就会达到最高，分解的速度则非常低，该种物质大量生成。而一旦原料逐渐缺乏，合成的速度就会逐渐降下来，而分解的速度因为该种物质的浓度上升而加快，最终合成速度跟分解速度一样了，此种物质的含量就稳定下来了。） 如果所有的反应都是自发的进行，那么最终所有的物质的含量应该是恒定的。但是如果任何一种拥有稳定自身（或者破坏其他分子）的分子007的存在，都会产生更多的该种个体007。（这种增加是在分解其他分子的基础上进行的，为什么呢？因为当大家都处于一种动态平衡的时候，只有把原料的浓度给降下来，那么其他的分子就会分解一些，但是，这些新产生的原料不会再形成其他分子了，而是被用来增加这种特定分子007的含量）然而最终，这种分子也会达到化学平衡状态的含量稳定。

如果所有的分子都这么循规蹈矩的话，那么我们也就不会出现在地球上了。但是在现实中，绝大多数的分子都达不到平衡点，（就好像一大群人抢着吃东西，人多东西少，结果肯定是不可能大家都吃饱）。这个时候，最早的生存竞争就出现了。大家都在争夺那有限的物质资源。

打破这种平衡的，是一种被称为自身催化剂的分子，这种分子的可以催化原料形成自己，加快合成的速度。自私自利的家伙总是最先发迹的。而最适合作为催化剂的分子，一是蛋白，一是核酸。因为这两种物质都足够稳定，并可能产生足够的结构变化来满足各种催化需求。

在这些最早出现的自身催化剂暴发户中，逐步出现了友谊的存在，偶然几个暴发户凑在一起，发现可以大大增加这一小撮坏家伙合成的速度，从而进一步增加了这些物质的含量，并进一步增加了合成速度。

然而好景不长，外界狂暴的大自然，很容易就可以摧毁这些短暂的组合。外在的有毒物质，水流，蒸发，……很快就让这些暴发户联合成为泡影。

终于有一天，几个暴发户被一种叫做脂质体的东西连同一堆原料和其他分子给包了进去。结果暴发户联合在里面闷声发大才，很快就形成了独霸江山的状态。但是好景不长，有一天，这个脂质体完蛋了，暴发户联合也流离失所。随着水流，被风吹雨打去了。

同样的故事在一天天的上演着，暴发户联合的规模也逐渐在上升，有时候甚至出现了几个主要的暴发户联合纠集成一堆，相互合作的良好事态。而脂质体也不时地吞进几个联合去，让他们高兴几天。就这样，一万年过去了，两万年过去了，三万年过去了，四万年过去了……（水风被铁手一脚踢了出去，你在这里催眠呢？）

亿万年过去了。终于，有一天，一堆合作良好的暴发户联合被幸运的吞了下去。这对家伙幸运的发现在那个什么脂质体上竟然没有被消灭，而是开始跟其它的脂质体合并了。这个超级脂质体的同类也逐步出现了，（注：这可不是什么神迹，是因为地球的造山运动已经逐步平息了下来，地壳表面也逐步冷却，火山不再爆发，整个地球风和日丽，就像外面的风景，是个出现点什么奇迹的好日子）。然后，是细胞（就是那个超级脂质体）进化开始了，根据被吞进去的暴发户联合的不同，各种脂质体具有了不同的特性。并不断的相互融合，吞噬，里面的暴发户组合也不断的重新洗牌。一千年过去了，两千年过去了，……（看看不爱吱声没有来，铁手也没有踢我，抹了把汗）就这样，一万年过去了，两万年过去了，三万年过去了，四万年过去了……终于有一天，电闪雷鸣，一颗小行星撞到了地球上，于是又是火山爆发，又是超级海啸。总而言之，整个地球又陷入了地狱一般的场面。（又该有脂质体该倒霉了）。于是，第一次自然选择出现了，大多数倒霉的脂质体被消灭了，或者被弄得体无完肤，不成样子。少数的几个完美的，类似后代细胞样的脂质体们……也没有逃脱厄运。（嘘，这不是YY小说，主人公这么早就想上场，拜托，李福贵说过，领先半步，领先一步就会被烧死。你丫几个细胞这么早就出来抢工资，不毙了你们，历史怎么办）

于是，历史大倒退，除了留下了几个极少数的幸运儿，大多数脂质体们退化了好几代。而那几个领先者也没有逃脱被同化的厄运。于是，就这样，一万年过去了，两万年过去了，三万年过去了，四万年过去了……

终于，有一天，又是风和日丽。当当当当，当当当当，当当当当~，天气很好，脂质体们又开始出来串门，又开始融合进化。黄金时代又回来了。一千年过去了，两千年过去了，……（看看不爱吱声和铁手都没有来，又抹了把汗）就这样，一万年过去了，两万年过去了，三万年过去了，四万年过去了……终于有一天，电闪雷鸣，一颗小行星撞到了地球上，于是又是火山爆发，又是超级海啸。总而言之，真个地球又陷入了地狱一般的场面。（该有人，不，是有脂质体该倒霉了）。

但是这一次，因为经过了上次的教训和演化，更多的脂质体们存活了下来。（嘿嘿，先让你们高兴几天）但是，新的危机出现了，这一次，火山爆发远远超过上次，水中含硫量直线上升，绝大多数的原始海洋成了硫酸湖，更多的直接被蒸发干了。脂质体们又是大死一批。

…………

在我，不是，在大自然几次三番的折腾下，终于，1亿年过去了，又1亿年过去了……留下来的脂质体们终于变得精明强干，里面的暴发户组合也变得逐渐固定下来了。甚至有暴发户组合可以自己合成部分组成脂质体的原料。这个时候，当当当当，灯光，音像，场记，场务，镜头，大家注意了，演员登场。（光柱打下，音乐声起，）一群脂质体们随波流了过来，还没等说话，就被送了回去。

在地壳冷却了近五亿年之后，第一群真正意义上的细胞出现了。在这些细胞里面，有了几大类合作良好的暴发户组合，有些暴发户组合专门生产其他的暴发户们，有的专门生产吃的，有的专门指导其他的暴发户们运作。当然，这个时候的细胞，和我们现在的细胞相比，还是有很大的差异。历史还需要几亿年来逐步将这些暴发户组合们给稳定下来。并真正把一切有用信息记录到细胞本身专用的记事本DNA上。这个过程本身，我们还没有任何资料可以考虑来追踪这个过程。所以下一章，将是完全的妖道所言。到了第三章，我们再回到已知知识基础上的细胞进化。

待续

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