主题：【原创】从台湾诈保案聊起——DNA鉴定的前世今生 -- 游识猷

EtBr加在胶里或者事后染色，除了方便的考虑，选择这两种方法，还要考虑这个问题：EtBr带正电，DNA的移动速率会受插入量的影响，EtBr插得越多DNA跑得越慢。这对某些用途来说不是很理想。

此外因为EtBr带正电，它的前界面会相对DNA做相向运动（在1％琼脂糖里的移动速率大概相当于几百bp的DNA片断），所以还没等DNA跑到头，小一些的DNA片段就已经跑出EtBr的前界面了，在低EtBr浓度的氛围里，DNA里插的EtBr会慢慢掉下来，荧光检测信号就低了。这对检测DNA的灵敏度和定量影响比较大。

所以把EtBr放在胶里，并不是很理想的做法。但是这样做比较方便，所以很流行。

事后放在EtBr里泡，从定量和测分子量的角度看，是最理想的。缺点是EtBr是在液体里，而且相对浓度要高一些，污染的可能性要大一些。此外多花5分钟泡胶也有点麻烦。一般情况下没必要给自己找这些麻烦。

另外，琼脂糖是琼脂除去了[带硫酸基团成分(这个词组比较长)]——琼脂胶的产物，它是不带电荷的，所以用来搞电泳很合适，不过要比琼脂贵许多（纯度比较高的就更加贵）。琼脂在中性pH附近带负电荷，而在带电基质里的电泳不很理想，受电渗的干扰比较大，因此琼脂做电泳基质是不很理想的。假如要跑带正电的东西还得考虑电荷相互作用的问题。

琼脂是直接从海藻里提取的，用在食品工业上的纯度也不算很高，所以很便宜，可以按公斤加。

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