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主题:【原创】谈谈大学的变迁1 -- duhao

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家园 信息和软件是内在与表象的东西

软件只是实现的工具,而核心是信息的提取,或者说算法

一旦这批数据处理完毕之后,或者有了优秀的算法引导出的超级好用的软件出现,生物信息学恐怕也会很快的衰落下去的。

CS的核心是算法而不是软件,向来没人以为软件就是CS的全部。BioInfo的kernal是算法,好的算法意味着BioInfo的发展而不是衰落。但是其独特的特点在于这里所说的算法并非纯粹数学上的东西,既然生命科学本身就不成熟,现在看起来成功的算法本身就融入了数学和生物/医学知识的结果。纯粹的依赖数学,其实就是简单的认为BioInfo = Apply pure Algorithm on biological/medical data。 That's definitely wrong.

至于数据,正是因为在未来5到10年中会有海量的数据出现,对学校的研究者来讲,要面对从未有过的数据量(普通得case也许是kT,也许是MT),需要新的算法来解决,而对公司的人员来说,则是开发出具有更高信噪比,降低false positive的设备和工艺。等把这一批数据处理完,也许可以说,基于人类的信息处理告一段落,不过一个类似的比喻就是如果我们明白了大脑,神经生物学也走到了尽头,但是这个尽头在可以预见的将来是看不到的。

90年代早期的分子生物学是多么辉煌啊,现在已经成了常规的实验手段了。

这不正是一门科学成熟的表现,数学,物理,量化的化学学科很多不都变成了常规手段吗?分子生物学/遗传学研究了这么多年,难道我们就真得能回答所有有关基因的问题吗?基因图谱搞出了这么多年,谁能告诉大家所有人类基因是如何表达,调控以及相互作用的?等所有这些问题都能够回答清楚了,生物信息也就可以消失了,不过也许遗传学也就可以消失了。

生物信息的目的就是要发展成常规手段,但是基于生物系统的复杂性,这个目的几十年内是很难实现的。所以好的生物信息的分析员必须要有足够的生物/医学系统训练,也许在我们这代人,对于分析结果的最终解释仍然依赖于人脑而非电脑。

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