主题：【整理】老鼠不见了 谁动了它们的基因？——山西、吉林 -- 司徒摘杏

玉米水稻的全基因测序比拟南芥困难的多得多，或者换过来说更合适，拟南芥的全基因组测序比玉米水稻容易的多的多。容易来自两方面

1.拟南芥基因组尺寸小结构紧凑，测序工作量小很多。这也是为什么它是第一个搞全基因测序的，容易啊。

2.拟南芥的全基因组数据已经有了，你说的3000刀两周，其实是高通量测很多基因组的片段以后，再根据比对已知的基因组数据去拼装那些片段。而玉米水稻的基因组信息不全，gap非常多，这意味着你无法做比对了，拼装难度大多了。玉米在这点上，比水稻的困难还要大。此外植物基因组里面重复序列非常多，这是现在高通量测序技术的大敌。序列一样的短片段，你怎么知道往哪里装。玉米我不清楚，水稻的重复序列出现频率比拟南芥高不少，而且重复序列还长。测序的难度增加很多。我估计在这个问题上，玉米不会比拟南芥难度低。

很多鉴定转基因作物的技术，原理上非常简单。不就是PCR，最多巢式PCR，然后测序。其实操作起来，讲究还是不少的。否则国家也没必要搞什么转基因安全国家实验室了，直接给卫生局什么的配几台PCR仪就行了